Мда... печальная ситуация, молодой человек.
Axapta(приложение) - она или совершенно одинаковая, или абсолютно разная. Так что пишите на каких угодно слоях, все равно обмен данными придеться организовывать через промежуточные интерфейсы, скорее всего.
С Уважением,
Георгий.